AT90S1200のプログラミングは32個の汎用レジスターを利用しI/Oレジスターにアクセスすることによりいろいろな仕事をさせることができます。

■I/Oレジスター

EEARのように英大文字４〜5文字で表記してあるのはI/Oレジスターです。またEEAR(EERE)のように表記したときはレジスターEEARのEEREビットと言う意味です。またセットはこのビットを１に、クリアは０にすることです。

■システムフラグ　SREG
AT90S1200は８個のフラグを持ちます。この中で
Tフラグは汎用レジスターのビットの検査をします。汎用レジスターの各ビットをこのTにコピーする命令があり、コピー後Tの状態による条件ジャンプでTEST(分岐)します。また
Iフラグは割り込み許可のGENERALでこれを０にすることによりすべての割り込みを禁止します。Iを１にした後、割り込みが発生するとCPUはこのフラグを０にし続く割り込みが発生しないようにします。またRETI命令はルーチンからリターンするとともにIを１にし割り込みを許可します。

■I/Oポート　PORTB、DDRB,PINB　PORTD、DDRD,PIND
AT90S1200は８本のBポートと７本のDポートを持っています。これらのポートはI/OであるPORTB、DDRB,PINBおよびPORTD、DDRD,PINDの二組の３つのI/Oレジスターにアクセスすることにより操作できます。Dのビットは０〜６です。

PORTｘ：出力です。ここに書き込むことにより出力に設定されていればその値が出力されます。読出しもできます。
PINｘ：入力です。読出しのみ。
DDRｘ：入出力の切り替えです。相対するビットが０で入力、１で出力に設定します。
　　DDRｘを入力にした時PORTｘが０でハイインピーダンス、１でプルアップ。

■EEP-ROM　EEAR､EEDR､EECR
AT90S1200は64個の８ビットEEP-ROMを持っています。これは自由に読み書きすることができますがアクセスが遅いのでちょっとした工夫がしてあります。
読出しはアドレスをOUT命令でEEARに入れ、EECR(EERE)をセットします。４クロックの後EEDRからIN命令でデータを読み出すことができます。なお、CPUはEECR(EERE)がセットされEEDRにデータを出した後EECR(EERE)をクリアします。
書込みはデータをEEDRにOUTしアドレスをOUT命令でEEARに入れ、EECR(EEWE)をセットします。約3ms(VCCにより異なる)掛かってEEP-ROMにデータが記憶されます。同様に書込みが終了するとCPUはEECR(EEWE)をクリアします。
どちらの場合もEEWEやEEREをスキャンすることによって正しいデータが読み書きされたことがわかります。当然EEWEやEEREがセットしている状態で、次の読み書きを始めると値は保証されません。

■タイマー/カウンター　TCNT0､TCCR0､TIFR､TIMSK
AT90S1200はタイマーやカウンターとして使える８ビットのTCNT0レジスターを１つ持っています。これは入力として外部ピンPD4-T0を選ぶとカウンターとして、内部のクロックを使うとタイマーとして利用することができます。またTCCR0を設定することによりこの接続を切り替えることができます。

TCCR0
CS0２	CS01	CS00	TCCR0	動　　　　　　　作
0	0	0	0	TCNT0　カウントしない
0	0	1	1	クロックに直接接続
0	1	0	2	クロックを1/8分周して接続
0	1	1	3	〃　1/64　〃
1	0	0	4	〃　1/512　〃
1	0	1	5	〃　1/4096　〃
1	1	0	6	外部ピンに接続、パルス立下りでカウント
1	1	1	7	外部ピンに接続、パルス立上がりでカウント

TCNT0はカウント中オバーフローするとTIFR(TOV0)フラグをセットします。また同時に割り込み要求を出しますので、タイマー/カウンター割り込み許可のTIMSK(TOIE0)とSREG(I)がセットされていれば割り込みが発生します。

■コンパレータ　ACSR
PB0-ACP1が＋、PB1-ACN1を−入力とするコンパレータです。ACSRレジスターが担当します。まずコンパレータの電源の入切をACSR(ACD)が行い１で電源OFFです。コンパレータの出力はACSR(ACO)に出るのでこれを読み込み調べます。
コンパレータを割り込みのソースとする時はACSR(ACIE),SREG(I)をセットして許可します。割り込み発生のタイミングはACSR(ACIS0、ACIS1)が０の時ACSR(ACO)が変化する度に、立ち上がりで発生させるには３を、立ち下りでは２を設定します。
上記が揃うとフラグACSR(ACI)をセットし割り込みます。また割り込み許可後に電源のACSR(ACD)を変化させるとACSR(ACO)も変化し条件が合うと思わぬところで割り込みが発生します。

■割り込み
割り込みは外部割込、ﾀｲﾏｰ/ｶｳﾝﾀｰ割込、ｺﾝﾊﾟﾚｰﾀ割込の３種類があります。どの割り込みも条件が揃うとフラグを立て割り込みます。割り込むとそれに応じたアドレスに飛びルーチンを実行します。そのアドレスとして000〜003番地が当てられています。000はリセットとウォッチドッグ・タイムオーバで使われます。また条件として外部だけでなく内部の幾種かの許可が必要です。

	割込のｿｰｽ	許可ﾋﾞｯﾄ(1:許可)	フラグﾋﾞｯﾄ	制御レジスター	ルーチンのｱﾄﾞﾚｽ
�@外部割込	INT0/PD2ﾋﾟﾝ	GIMSK(INT0)	無い	MCUCR	&H001
�Aﾀｲﾏｰ 割込	内部クロック	TIMSK(TOIE0)	TIFR(TOV0)	TCCR0	&H002
ｶｳﾝﾀｰ割込	T0/PD4ﾋﾟﾝ	〃	〃	〃	〃
�Bｺﾝﾊﾟﾚｰﾀ割込	ACPI/PB0(+) ACNI/PB1(-)	ACSR(ACIE)	ACSR(ACI)	ACSR	&H003

■外部割込みピン　GIMSK､MCUCR
PD2-INT0は外部からの割り込み入力となっています。GIMSK(INT0),SREG(I)がセットされると割り込み許可となります。また割り込みの条件としてMCUCR(ISC00,ISC01)が２でPD2-INT0の立ち下り、３で立ち上がり時に発生します。